El clima de la región es tropical, con temperatura media anual de 26°C.
La región de los Lençóis Maranhenses, apesar del aparente aire desértico, tiene una periodo lluvioso que de manera general se extiende de diciembre a junio.
Las lluvias acostumbrar terminar un poco antes del inicio de las fiestas juninas, que inaugura el inicio de la alta temporada en Maranhão.
Todo el año es posible aprovechar las bellezas del Parque, pero si quiere encontrar las lagunas bastante llenas lo ideal es ir luego del periodo de lluvias.
IMPORTANTE: las compras realizadas con tarjetas de crédito argentinas, se pagan en pesos argentinos a la cotización del "dólar tarjeta / turista"