El clima en Concepción de Ataco - El Salvador es un clima tropical y ofrece condiciones térmicas similares durante todo el año.
La temperatura media anual es de 24.8 °C, siendo más baja en los meses de diciembre y enero (23 aprox.), mientras que el mes más cálido es abril (32.0 °C). La precipitación media anual es de 1823 mm.
El Salvador tiene dos estaciones: la seca (noviembre-abril) y la lluviosa (mayo-octubre). Además, el país se ve afectado por la estación de huracanes del Caribe (junio-noviembre).